命名实体识别的语料和代码

抱歉~之前比较忙,有很多朋友在我前几篇文章中留言都没有来得及回复,不过大部分留言都是找我要语料和代码的,貌似我在那几篇文章里写的不太清楚,这里就统一整理一下吧。

1.用规则做命名实体识别

原文:用规则做命名实体识别——NER系列(一)

这篇博文就不放出代码了,因为现在基本上不用规则做命名实体识别,当然除非你在某些特定的语料有规律,就完全可以用正则表达式来做。

2.用HMM做命名实体识别

原文:用隐马尔可夫模型(HMM)做命名实体识别——NER系列(二)

代码和语料:https://github.com/lipengfei-558/hmm_ner_organization

3.用CRF做命名实体识别

原文:用CRF做命名实体识别——NER系列(三)

这篇博文是根据我参加的一个比赛写的,当时用到了纯CRF方法,比赛介绍:
https://www.datafountain.cn/competitions/269/details/rule

数据集:https://pan.baidu.com/s/1hdC_W9E62w3Akzlo5pnQuA

用到了CRF++(版本0.58), CRF++ 下载地址:https://pan.baidu.com/s/11lsCwRlJ5DyfVM3NxH61iw

使用方法直接参考官方文档:http://taku910.github.io/crfpp/,或者直接参考网上教程。主要涉及到两点,一是数据的预处理,二是CRF++的模板,事实上,用默认模板也能取得不错的效果。想要更好的效果,就得好好设计一下模板,尝试把一些词性、特征词等特征加进去,不赘述了~

4.LSTM+CRF做命名实体识别

原文:用双向lstm+CRF做命名实体识别(附tensorflow代码)——NER系列(四)

代码是一个老哥在github上开源的,基于tensorflow:https://github.com/guillaumegenthial/sequence_tagging

CoNLL-2003语料集下载地址:https://pan.baidu.com/s/1Pps7QIfePoxc1t8iNSSafg

上面这个是已经做好预处理的语料集,也可以直接用在CRF++上。

最后祝大家新年快乐~

用双向lstm+CRF做命名实体识别(附tensorflow代码)——NER系列(四)


这一篇文章,主要讲一下用深度学习(神经网络)的方法来做命名实体识别。现在最主流最有效的方法基本上就是lstm+CRF了。其中CRF部分,只是把转移矩阵加进来了而已,而其它特征的提取则是交由神经网络来完成。当然了,特征提取这一部分我们也可以使用CNN,或者加入一些attention机制。

接下来,我将参考国外的一篇博客《Sequence Tagging with Tensorflow》,结合tensorflow的代码,讲一下用双向lstm+CRF做命名实体识别。


1.命名实体识别简述

命名实体识别任务本质上就是序列标注任务。来一个例子:

John  lives in New   York  and works for the European Union
B-PER O     O  B-LOC I-LOC O   O     O   O   B-ORG    I-ORG

在CoNLL2003任务中,实体为LOC,PER,ORG和MISC,分别代表着地名,人名,机构名以及其他实体,其它词语会被标记为O。由于有一些实体(比如New York)由多个词组成,所以我们使用用一种简单的标签体系:

B-来标记实体的开始部分,I-来标记实体的其它部分。

我们最终只是想对句子里面的每一个词,分配一个标签。

2.模型

整个模型的主要组成部分就是RNN。我们将模型的讲解分为以下三个部分:

  1. 词向量表示
  2. 词的上下文信息表示
  3. 解码

2.1 词向量表示

对于每一个单词,我们用词向量w \in \mathbb{R}^n来表示,用来捕获词本身的信息。这个词向量由两部分concat起来,一部分是用GloVe训练出来的词向量w_{glove} \in \mathbb{R}^{d_1},另一部分,是字符级别的向量w_{chars} \in \mathbb{R}^{d_2}

在以往,我们会手工提取并表示一些特征,比如用1,0来表示某个单词是否是大写开头,而在这个模型里面,我们不需要人工提取特征,只需要字符级别上面使用双向LSTM,就可以提取到一些拼写层面的特征了。当然了,CNN或者其他的RNN也可以干类似的事情。

Word level representation from characters embeddings

对于每一个单词w = [c_1, \ldots, c_p]里面的每一个字母(区分大小写),我们用c_i \in \mathbb{R}^{d_3}这个向量来表示,对字母级别的embedding跑一个bi-LSTM,然后将最后的隐状态输出拼接起来(因为是双向,所以有两个最后隐状态,如上图),得到一个固定长度的表达w_{chars} \in \mathbb{R}^{d_2},直觉上,我们可以认为这个向量提取了字母级别的特征,比如大小写、拼写规律等等。然后,我们将这个向量w_{chars}和Glove训练好的w_{glove}拼接起来,得到某个词最终的词向量表达:w = [w_{glove}, w_{chars}] \in \mathbb{R}^n,其中n = d_1 + d_2

看一下tensorflow对应的实现代码。

# shape = (batch size, max length of sentence in batch)
word_ids = tf.placeholder(tf.int32, shape=[None, None])

# shape = (batch size)
sequence_lengths = tf.placeholder(tf.int32, shape=[None])

好了,让我们用tensorflow的内置函数来读取word embeddings。假设这个embeddings是一个由GloVe训练出来的numpy数组,那么embeddings[i]表示第i个词的向量表示。

L = tf.Variable(embeddings, dtype=tf.float32, trainable=False)
# shape = (batch, sentence, word_vector_size)
pretrained_embeddings = tf.nn.embedding_lookup(L, word_ids)

在这里,应该使用tf.Variable并且参数设置trainable=False,而不是用tf.constant,否则可能会面临内存问题。

好,接下来,让我们来对字母建立向量。

# shape = (batch size, max length of sentence, max length of word)
char_ids = tf.placeholder(tf.int32, shape=[None, None, None])

# shape = (batch_size, max_length of sentence)
word_lengths = tf.placeholder(tf.int32, shape=[None, None])

为什么这里用这么多None呢?

其实这取决于我们。在我们的代码实现中,我们的padding是动态的,也就是和batch的最大长度对齐。因此,句子长度和单词长度取决于batch。

好了,继续。在这里,我们没有任何预训练的字母向量,所以我们调用tf.get_variable来初始化它们。我们也要reshape一下四维的tensor,以符合bidirectional_dynamic_rnn的所需要的输入。代码如下:

# 1. get character embeddings
K = tf.get_variable(name="char_embeddings", dtype=tf.float32,
    shape=[nchars, dim_char])
# shape = (batch, sentence, word, dim of char embeddings)
char_embeddings = tf.nn.embedding_lookup(K, char_ids)

# 2. put the time dimension on axis=1 for dynamic_rnn
s = tf.shape(char_embeddings) # store old shape
# shape = (batch x sentence, word, dim of char embeddings)
char_embeddings = tf.reshape(char_embeddings, shape=[-1, s[-2], s[-1]])
word_lengths = tf.reshape(self.word_lengths, shape=[-1])

# 3. bi lstm on chars
cell_fw = tf.contrib.rnn.LSTMCell(char_hidden_size, state_is_tuple=True)
cell_bw = tf.contrib.rnn.LSTMCell(char_hidden_size, state_is_tuple=True)

_, ((_, output_fw), (_, output_bw)) = tf.nn.bidirectional_dynamic_rnn(cell_fw,
    cell_bw, char_embeddings, sequence_length=word_lengths,
    dtype=tf.float32)
# shape = (batch x sentence, 2 x char_hidden_size)
output = tf.concat([output_fw, output_bw], axis=-1)

# shape = (batch, sentence, 2 x char_hidden_size)
char_rep = tf.reshape(output, shape=[-1, s[1], 2*char_hidden_size])

# shape = (batch, sentence, 2 x char_hidden_size + word_vector_size)
word_embeddings = tf.concat([pretrained_embeddings, char_rep], axis=-1)

注意sequence_length这个参数的用法,它让我们可以得到最后一个有效的state,对于无效的time steps,dynamic_rnn直接穿过这个state,返回零向量。

2.2 词的上下文信息表示

当有了词向量w之后,就可以对一个句子里的每一个词跑LSTM或者双向LSTM了,然后得到另一个向量表示:h \in \mathbb{R}^k,如下图:
利用双向LSTM提取上下文信息

对应的tensorflow代码很直观,这次我们用每一个隐藏层的输出,而不是最后一个单元的输出。因此,我们输入一个句子,有m个单词:w_1, \ldots, w_m \in \mathbb{R}^n,得到m个输出:h_1, \ldots, h_m \in \mathbb{R}^k。现在的输出,是包含上下文信息的:

cell_fw = tf.contrib.rnn.LSTMCell(hidden_size)
cell_bw = tf.contrib.rnn.LSTMCell(hidden_size)

(output_fw, output_bw), _ = tf.nn.bidirectional_dynamic_rnn(cell_fw,
    cell_bw, word_embeddings, sequence_length=sequence_lengths,
    dtype=tf.float32)

context_rep = tf.concat([output_fw, output_bw], axis=-1)

2.3 解码

最后,我们要对每一个词分配一个tag。用一个全连接层就可以搞定。

假如,一共有9种tag,那么我们可以得到权重矩阵W \in \mathbb{R}^{9 \times k}和偏置矩阵b \in \mathbb{R}^9,最后计算某个词的得分向量s \in \mathbb{R}^9 = W \cdot h + b,s[i]可以解释为,某个词标记成第i个tag的得分,tensorflow的实现是这样的:

W = tf.get_variable("W", shape=[2*self.config.hidden_size, self.config.ntags],
                dtype=tf.float32)

b = tf.get_variable("b", shape=[self.config.ntags], dtype=tf.float32,
                initializer=tf.zeros_initializer())

ntime_steps = tf.shape(context_rep)[1]
context_rep_flat = tf.reshape(context_rep, [-1, 2*hidden_size])
pred = tf.matmul(context_rep_flat, W) + b
scores = tf.reshape(pred, [-1, ntime_steps, ntags])

在这里,我们用zero_initializer来初始化偏置。

有了分数之后,我们有两种方案用来计算最后的tag:

  • softmax:将得分归一化为概率。
  • 线性CRF:第一种方案softmax,只做了局部的考虑,也就是说,当前词的tag,是不受其它的tag的影响的。而事实上,当前词tag是受相邻词tag的影响的。定义一系列词w_1, \ldots, w_m,一系列的得分向量s_1, \ldots, s_m,还有一系列标签y_1, \ldots, y_m,线性CRF的计算公式是这样的:

    \[\begin{aligned}C(y_1, \ldots, y_m) &= b[y_1] &+ \sum_{t=1}^{m} s_t [y_t] &+ \sum_{t=1}^{m-1} T[y_{t}, y_{t+1}] &+ e[y_m]\\&= \text{begin} &+ \text{scores} &+ \text{transitions} &+ \text{end}\end{aligned}\]

在上面的式子里,T是转移矩阵,尺寸为\mathbb{R}^{9 \times 9},用来刻画相邻tag的依赖、转移关系;e, b \in \mathbb{R}^9是结束、开始tag的代价向量。下面是一个计算例子:转移得分计算例子

了解了CRF得分式子,接下来要做两件事:

  • 找到得分最高的tag序列。
  • 计算句子的tag概率分布。

“仔细想想,计算量是不是太大了?”

没错,计算量相当大。就上面的例子而言,有9种tag,一个句子有m个单词,一共有9^m种可能,代价太大了。

幸运的是,由于式子有递归的特性,所以我们可以用动态规划的思想来解决这个问题。假设\tilde{s}_{t+1} (y^{t+1})是时间步t+1, \ldots, m的解(每个时间步都是有9种可能的),那么,继续往前推,时间步t, \ldots, m的解,可以由下式表示:

    \[\begin{aligned}\tilde{s}_t(y_t) &= \operatorname{argmax}_{y_t, \ldots, y_m} C(y_t, \ldots, y_m)\\&= \operatorname{argmax}_{y_{t+1}} s_t [y_t] + T[y_{t}, y_{t+1}] + \tilde{s}_{t+1}(y^{t+1})\end{aligned}\]

每一个递归步骤的复杂度为O(9 \times 9),由于我们进行了m步,所以总的复杂度是O(9 \times 9 \times m)

最后,我们需要在CRF层应用softmax,将得分概率分布计算出来。我们得计算出所有的可能,如下式子:

    \[\begin{aligned}Z = \sum_{y_1, \ldots, y_m} e^{C(y_1, \ldots, y_m)}\end{aligned}\]

上面提到的递归思想在这里也可以应用。先定义Z_t(y_t),表示从时间步t开始、以y_t为tag开始的序列,计算公式如下:

    \[\begin{aligned}Z_t(y_t) &= \sum_{y_{t+1}} e^{s_t[y_t] + T[y_{t}, y_{t+1}]} \sum_{y_{t+2}, \ldots, y_m} e^{C(y_{t+1}, \ldots, y_m)} \\&= \sum_{y_{t+1}} e^{s_t[y_t] + T[y_{t}, y_{t+1}]} \ Z_{t+1}(y_{t+1})\\\log Z_t(y_t) &= \log \sum_{y_{t+1}} e^{s_t [y_t] + T[y_{t}, y_{t+1}] + \log Z_{t+1}(y_{t+1})}\end{aligned}\]

最后,序列概率计算式子如下:

    \[\begin{aligned}\mathbb{P}(y_1, \ldots, y_m) = \frac{e^{C(y_1, \ldots, y_m)}}{Z}\end{aligned}\]

2.4 训练

最后,就是训练部分了。训练的损失函数采用的是cross-entropy(交叉熵),计算公式如下:

    \[\begin{aligned}- \log (\mathbb{P}(\tilde{y}))\end{aligned}\]

其中,\tilde{y}为正确的标注序列,它的概率\mathbb{P}计算公式如下:

  • CRF:\mathbb{P}(\tilde{y}) = \frac{e^{C(\tilde{y})}}{Z}
  • local softmax:\mathbb{P}(\tilde{y}) = \prod p_t[\tilde{y}^t]

“额..CRF层的损失很难计算吧..?”

没错,但是大神早就帮你做好了。在tensorflow里面,一行就能调用。下面的代码会帮我们计算CRF的loss,同时返回矩阵T,以助我们做预测:

# shape = (batch, sentence)
labels = tf.placeholder(tf.int32, shape=[None, None], name="labels")

log_likelihood, transition_params = tf.contrib.crf.crf_log_likelihood(
scores, labels, sequence_lengths)

loss = tf.reduce_mean(-log_likelihood)

local softmax的loss计算过程很经典,但我们需要用tf.sequence_mask将sequence转化为bool向量:

losses = tf.nn.sparse_softmax_cross_entropy_with_logits(logits=scores, labels=labels)
# shape = (batch, sentence, nclasses)
mask = tf.sequence_mask(sequence_lengths)
# apply mask
losses = tf.boolean_mask(losses, mask)

loss = tf.reduce_mean(losses)

最后,定义train op:

optimizer = tf.train.AdamOptimizer(self.lr)
train_op = optimizer.minimize(self.loss)

2.5 使用模型

最后的预测步骤很直观:

labels_pred = tf.cast(tf.argmax(self.logits, axis=-1), tf.int32)

至于CRF层,仍然用到上面提到过的动态规划思想。

# shape = (sentence, nclasses)
score = ...
viterbi_sequence, viterbi_score = tf.contrib.crf.viterbi_decode(
                                score, transition_params)

最终通过这份代码,F1值能跑到90%到91%之间。


3.后记

神经网络做NER,大部分套路都是这样:用基本的RNN、CNN模型做特征提取,最后加上一层CRF,再加点attention机制能稍微提升一下效果,基本上就到瓶颈了。

在2017年6月份,谷歌团队出品这篇论文《Attention Is All You Need》还是给我们带来不少震撼的,不用RNN,CNN,只用attention机制,就刷新了翻译任务的最好效果。所以,我们是不是可以想,把这种结构用到命名实体识别里面呢?

果然,已经有人开始做相关研究。《Deep Semantic Role Labeling with Self-Attention》这篇论文发表于2017年12月,实现了一个类似刚才说到的谷歌的模型,做的是SRL任务,也取得了不错的效果,同时他们也有放出实现代码:https://github.com/XMUNLP/Tagger

值得学习一下。

另外,用多模态来做实体识别也是一个方向,特别是对于一些类似微博的语料(有图片),这样做效果更佳。

代码和语料:
https://www.lookfor404.com/命名实体识别的语料和代码/

用CRF做命名实体识别——NER系列(三)

在上一篇文章《用隐马尔可夫模型(HMM)做命名实体识别——NER系列(二)》中,我们使用HMM模型来做命名实体识别,将问题转化为统计概率问题,进行求解。显然,它的效果是非常有限的。

在深度学习技术火起来之前,主流的、最有效的方法,就是CRF(条件随机场)模型。本文不对CRF模型进行展开讲解,而是结合我之前参加的CCF BDCI的其中一个赛题,直接用CRF++工具进行实战。下面直接进入正题。

1.赛题解读

赛题介绍:https://www.datafountain.cn/competitions/269/details/rule

任务描述

总结一下,这个题目要求我们对数据集中的每条记录,提取出正文中的主要机构实体,判断这些机构的风险等级(中性,正向或负向),并为每个实体生成相应的摘要和关键词。

我接下来主要讲提取实体这一部分,用的是CRF模型,训练直接使用CRF++工具(http://taku910.github.io/crfpp/)(似乎被墙了?)。

2.算法流程图

算法流程图

3.算法说明

3.1 定义实体标注集

为了确保最后的机构实体识别准确度,使用BMEWO标注集,各个标注的意义如下:

B:实体的开头

M:实体的中间部分

E:实体的结束

W:单独成实体

O:句子的其它成分

比如下面这个句子(已做分词处理):

山西      相立      山泉      饮品      开发      有限公司     生产      的桶装  饮用水  检出      铜绿      假   单胞菌

背后的标注为:

山西/B  相立/M 山泉/M 饮品/M 开发/M 有限公司/E  生产/O  的/O 桶装/O     饮用水/O     检出/O  铜绿/O   假/O 单胞菌/O

3.2训练文本、测试文本预处理

对训练文本进行中文分词、去除停用词的处理,并根据上述的标注集进行标注。同时,除了词本身,还引入了4个特征:

特征:【词性】,用jieba分词识别出来的词性

特征②:【是否是特征词】,该词是特征词,标记1;不是特征词,标记0。这里的特征词是指“实体通常的结尾词”,比如“有限公司”,“药监局”,“超市”等等,这些特征词来源于两个地方:

  1. 从训练集中分词得到。
  2. 从开源中文分词工具hanlp的机构名词典中整理得到。

特征③:【是否是地点】,该词是地点,标记为isloc;该词不是地点,标记为notloc。这里的地点信息我们是从jieba的分词词性标注功能中得到的,词性标注为ns的一般是地点。

特征④:【是否是句子结束】,该词是这个句子的结束词,标记为isend;否则标记为notend。

训练文本在经过预处理之后,格式如下:

宁夏      ns   0     isloc      notend B

物美      nz   0     notloc  notend M

超市      v     1     notloc  notend M

有限公司    n     1     notloc  notend M

森林公园    n     0     notloc  notend M

   n     1     notloc  isend    E

其中,第一列为词本身,第二列为特征①,第三列为特征②,第四列为特征③,第五列为特征④,第六列列为正确标注。

测试文本的预处理和上面的基本一样,区别在于,测试文本没有正确的实体标注,所以测试文本的预处理文件只有五列。最后我们要用CRF模型预测的是第六列标注。

3.3训练CRF模型

CRF模型的训练,需要一个特征模板,以便能够自动在训练文本中提取特征函数,特征模板的定义直接决定了最后的识别效果

针对此次的机构实体,我们定义了几种特征模板,最终选择了以下模板:

# Unigram

U01:%x[-2,0]

U02:%x[-1,0]

U03:%x[0,0]

U04:%x[1,0]

U05:%x[2,0]

U06:%x[-2,0]/%x[-1,0]/%x[0,0]

U07:%x[-1,0]/%x[0,0]/%x[1,0]

U08:%x[0,0]/%x[1,0]/%x[2,0]

U09:%x[-1,0]/%x[0,0]

U10:%x[0,0]/%x[1,0]

U11:%x[-1,1]/%x[0,1]/%x[1,1]

U12:%x[-1,1]/%x[0,1]

U13:%x[0,1]/%x[1,1]

U14:%x[0,1]/%x[0,2]

U15:%x[-1,1]/%x[0,2]

U16:%x[-2,1]/%x[-1,1]/%x[0,2]

U17:%x[-1,1]/%x[0,2]/%x[1,1]

U18:%x[0,2]/%x[1,1]/%x[2,1]

U19:%x[0,0]/%x[0,2]

U20:%x[-1,0]/%x[0,2]

U21:%x[-2,0]/%x[-1,0]/%x[0,2]

U22:%x[-1,0]/%x[0,2]/%x[1,0]

U23:%x[0,2]/%x[1,0]/%x[2,0]

# Bigram

B

下面解释一下上述特征模板:

①Unigram类型

每一行%x[#,#]生成一个CRFs中的点(state)函数: f(s, o), 其中s为t时刻的标签(output),o为t时刻的上下文以及特征信息。

比如:U06:%x[-2,0]/%x[-1,0]/%x[0,0]

U06是指这个特征模板的编号,对于%x[-2,0]而言,%x是指找到的字符;[-2,0]是定位信息,其中中括号里面的-2是指当前词的前两个词,0是指第0列。后面用/连接的是多个特征的组合。

对于以下的训练文本:

宁夏     ns   0     isloc      notend B

物美     nz   0     notloc  notend M

超市     v     1     notloc  notend M

有限公司   n     1     notloc  notend M

森林公园   n     0     notloc  notend M

  n     1     notloc  isend    E

假如当前识别到第三行,则U06:%x[-2,0]/%x[-1,0]/%x[0,0]对应识别出来的文本为宁夏/物美/超市。

这就相当于我们在文本中找到的一条特征。

②Bigram类型

每一行%x[#,#]生成一个CRFs中的边(Edge)函数:f(s’, s, o), 其中s’为t – 1时刻的标签.也就是说,Bigram类型与Unigram大致机同,只是还要考虑到t – 1时刻的标签.这里只写一个B,默认生成f(s’, s).

有了特征模板以及训练文本文件,就可以进行CRF模型训练了,我们采用了CRF++这个开源工具包进行训练,使用默认参数,最终模型识别出来的特征有11616755条。

3.4预测、生成实体

有了上述预处理测试文本和训练生成的CRF模型,我们可以进行测试文本的标签预测,生成crf_test_output.txt

由于crf_test_output.txt里面预测的是每个词背后的标注,我们还要做一个后处理工作才能把真正的实体提取出来。

用正则表达式B+M*E+或者W匹配文本,然后将其背后的文字提取出来,就是识别出来的机构实体。

3.4效果和缺点

在使用CRF模型之后,我们得到了不错的效果。线下训练文本的实体召回率可以达到91.3%,另外,识别出来的无效实体也少了很多。

和基于规则的实体识别相比,它有着以下优点:

  • 通过特征模板,能够最大限度的挖掘文本的特征,而不需要人工提取。
  • 能够考虑大量的上下文信息、特征。
  • 考虑了相邻词的标注信息,这是传统的最大熵算法所不具备的。
  • 和神经网络模型相比,CRF模型的可解释性强,具体到每一个特征都有可以解释的意义。因此调整起来比较容易。

当然,这个模型也不是完美的,比如,我们训练的这个模型就比较“看重”机构特征词。举个例子,如果“下属公司”单独出现,则它也可能会被识别为机构名,需要我们人工定义一些规则将其去除。


CRF++工具的使用就没有介绍了,训练的过程只需要预处理语料以及模板文件,预处理语料格式和模板文件,在上文已经体现出来了,感兴趣的朋友,缺少语料或者工具,可以找我要。

代码和语料:
https://www.lookfor404.com/命名实体识别的语料和代码/